Contribuciones del usuario Glyco
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- 16:40 20 mar 2022 difs. hist. +120 Usoslurm
- 16:38 20 mar 2022 difs. hist. +213 ClusterQB:Infra
- 16:37 20 mar 2022 difs. hist. +2442 Usoslurm
- 15:33 20 mar 2022 difs. hist. +617 N Recursos Página creada con «El cluster cuenta con el siguiente equipamiento: * nodo1 CPUs=24 Memory=62 Gb 1 geforce_gtx_1080ti * nodo2 CPUs=12 Memory=62 Gb 2 geforce_gtx_1080ti * nodo3 CPUs=12 Memory=62 Gb 2 geforce_rtx_2080 * nodo4 CPUs=12 Memory=62 Gb 2 geforce_rtx_2080 * nodo5 CPUs=12 Memory=46 Gb 2 geforce_rtx_2080 * nodo6 CPUs=12 Memory=62 Gb 2 geforce_rtx_2080 * nodo7 CPUs=12 Memory=62 Gb 2 geforce_rtx_2080 * nodo8 CPUs=12 Memory=62 Gb 2 geforce_rtx_2080 * nodo9 CPUs=12 Memory=62…»
- 15:25 20 mar 2022 difs. hist. +856 N Conexion cluster qb Página creada con «= Datos para crear la cuenta = Para crear el usuario se deben proveer los siguientes datos: * nombre de la persona * email * lugar de trabajo * descripcion breve de los trabajos a correr * Clave RSA publica. Si no sabe que es, lea * Crear claves ssh = Como conectarse al cluster = Primero que nada, tienen que tener un nombre de usuario, resultado de haber completado el paso anterior. Con un cliente de SSH (Putty,MobaXterm para Windows por ejemplo, con L…» última
- 14:53 20 mar 2022 difs. hist. +417 Página principal
- 17:55 14 mar 2022 difs. hist. +21 Usoslurm
- 17:48 14 mar 2022 difs. hist. +115 ClusterQB:Quilombos →Low RealMemory
- 13:15 14 mar 2022 difs. hist. +1523 N ClusterQB:Monitoreo Página creada con «La informacion del monitoreo del cluster se visualiza con [https://grafana.com/ Grafana]. Para eso hay instalada una [https://www.influxdata.com/ InfluxDB], de la cual grafana recolecta los datos y los nodos le reportan a la InfluxDB usando el programa [https://glances.readthedocs.io/en/latest/gw/influxdb.html|Glances] Por ahora Grafana y la InfluxDB estan en dualipa. En cuanto a grafana, tiene configurado un unico datasource que es la InfluxDB. Cada nodo tiene la…»
- 12:55 14 mar 2022 difs. hist. +383 ClusterQB:Quilombos
- 20:34 9 mar 2022 difs. hist. +257 ClusterQB:Red
- 13:23 7 mar 2022 difs. hist. +999 ClusterQB:Red
- 17:55 4 mar 2022 difs. hist. +417 Usoslurm
- 14:26 4 mar 2022 difs. hist. +147 ClusterQB:Usuarios
- 15:09 3 mar 2022 difs. hist. +378 ClusterQB:Red →Agregar nodo
- 15:09 3 mar 2022 difs. hist. +533 ClusterQB:Slurm
- 14:04 3 mar 2022 difs. hist. +234 ClusterQB:Quilombos
- 13:46 3 mar 2022 difs. hist. +56 ClusterQB:Slurm →GPUs
- 13:20 3 mar 2022 difs. hist. +725 ClusterQB:Red
- 19:49 24 feb 2022 difs. hist. +105 ClusterQB:Alphafold última
- 19:48 24 feb 2022 difs. hist. +63 ClusterQB:Infra →Infraestructura y configuración del cluster
- 19:47 24 feb 2022 difs. hist. +3038 N ClusterQB:Alphafold Página creada con «https://github.com/deepmind/alphafold instalacion conda: - https://ccportal.ims.ac.jp/en/node/2946 - https://github.com/kuixu/alphafold name: alphafold channels: - bioconda - conda-forge - defaults dependencies: - _libgcc_mutex=0.1=conda_forge - _openmp_mutex=4.5=1_gnu - ca-certificates=2021.10.8=ha878542_0 - certifi=2021.10.8=py38h578d9bd_1 - cudatoolkit=11.0.3=h15472ef_8 - cudnn=8.2.1.32=h86fa8c9_0 - fftw=3.3.10=nompi_h77c792f_102 - hhsuite=…»
- 19:39 24 feb 2022 difs. hist. +65 ClusterQB:Infra
- 19:37 24 feb 2022 difs. hist. +50 ClusterQB:Infra
- 19:35 24 feb 2022 difs. hist. +120 ClusterQB:Wiki última
- 19:33 24 feb 2022 difs. hist. +148 ClusterQB:Slurm
- 19:32 24 feb 2022 difs. hist. +63 ClusterQB:Wiki
- 18:58 24 feb 2022 difs. hist. +2 Usoslurm
- 18:22 18 feb 2022 difs. hist. +1715 N ClusterQB:Red Página creada con «= Agregar nodo = formatear e instalar ubuntu 20.04 server, con ssh y proxy sudo apt install sssd libpam-sss libnss-sss sudo vim /etc/sssd/sssd.conf [sssd] services = nss, pam config_file_version = 2 domains = default [nss] [pam] offline_credentials_expiration = 60 [domain/default] ldap_id_use_start_tls = True cache_credentials = True ldap_search_base = dc=cranex,dc=cluster id_provider = ldap auth_provider = ldap chpass_provider = ldap access_provider = ldap ld…»
- 18:14 18 feb 2022 difs. hist. +11 Usoslurm
- 18:09 18 feb 2022 difs. hist. +7 Usoslurm
- 18:08 18 feb 2022 difs. hist. +956 N Usoslurm Página creada con «Todos los trabajos enviados, para que puedan ser ejecutados dentro de la cola, deben ejecutarse utilizando Slurm. Para eso se debe crear un archivo bash, que contenga que parametros utilizara el script, para que pueda ser encolado de acuerdo a los recursos disponibles. A continuacion hay un ejemplo de como correr blast: blast.sh <syntaxhighlight lang="bash"> #!/bin/bash #SBATCH -p debug #SBATCH --job-name=testg5pdb # Job name #SBATCH -e slurm-%j.err #SB…»
- 18:01 18 feb 2022 difs. hist. +91 Página principal
- 17:48 18 feb 2022 difs. hist. +3372 N ClusterQB:Quilombos Página creada con «= Se reinicia el nginx cuando se usa el systemctl = Ya esta arreglado, pero dejo el fix por las dudas: https://serverfault.com/questions/1041031/nginx-sometimes-gets-killed-after-reloading-it-using-systemd = Error al montar nfs = si pone blah blah " you might need a /sbin/mount.<type> " https://askubuntu.com/questions/525243/why-do-i-get-wrong-fs-type-bad-option-bad-superblock-error sudo apt install nfs-common sudo apt install sshfs = Trabajos en CG = No se…»
- 17:39 18 feb 2022 difs. hist. +54 ClusterQB:Slurm
- 17:32 18 feb 2022 difs. hist. +44 ClusterQB:Storage →para montar la unidad nfs desde fuera de la red
- 17:18 18 feb 2022 difs. hist. 0 ClusterQB:Slurm →Instalar cliente slurm
- 17:18 18 feb 2022 difs. hist. +7 ClusterQB:Slurm →Instalar cliente slurm
- 17:18 18 feb 2022 difs. hist. +14 ClusterQB:Slurm →Instalar cliente slurm
- 17:17 18 feb 2022 difs. hist. 0 ClusterQB:Slurm →Instalar cliente slurm
- 17:17 18 feb 2022 difs. hist. +1787 N ClusterQB:Slurm Página creada con «= Instalar cliente slurm = En debian/ubuntu es solo apt install ii slurm-client 19.05.5-1 amd64 SLURM client side commands ii slurm-wlm 19.05.5-1 amd64 Simple Linux Utility for Resource Management ii slurm-wlm-basic-plugins 19.05.5-1 amd64 SLURM basic plugins ii slurm-wlm-basic-plugins-dev 19.05…»
- 17:10 18 feb 2022 difs. hist. +44 ClusterQB:Infra →Infraestructura y configuración del cluster
- 17:10 18 feb 2022 difs. hist. +775 N ClusterQB:Wiki Página creada con «Por ahora hosteada en Ragnar con un docker compose en /home/shared/wiki El docker compose lo exibe cranex con un reverse proxy usando ngnix --> https://hub.docker.com/_/mediawiki Los usuarios comunes no tienen permiso de registrarse ni editar. Pero si de ver paginas especiales, no se como prohibirlo, pero no creo que haya problema. Infraestructura tiene los hijos del namespace ClusterQB:* eso solo lo pueden ver los usuarios registrados. https://www.mediawiki.org/wi…»
- 17:08 18 feb 2022 difs. hist. +432 N ClusterQB:Storage Página creada con «= Storage = hay 2 storages bla blah. uno tiene montados los homes y los backups, /etc/fstab: nas:/userhomes /home nfs defaults 0 0 nas:/backups /mnt/backups nfs defaults 0 0 --> ver en ClusterQB:Red el /etc/hosts = para montar la unidad nfs desde fuera de la red = sudo ssh -L 111:192.168.0.90:111 -L 2049:192.168.0.90:2049 esosa@cluster.qb.fcen.uba.ar -i /home/eze/.ssh/id_rsa sudo mount localhost:/userhomes /home/shared»
- 16:58 18 feb 2022 difs. hist. +397 N ClusterQB:Usuarios Página creada con «https://ldap.cluster.qb.fcen.uba.ar/cmd.php?server_id=1&redirect=true ou: People Generic user account gid: clusterusers ... --> create object --> sshPublicKey --> copiar clave publica --> Update object Sobre la cuenta: En el menu de arriba - Add new attribute: Luego sobre los campos: objectClass --> (add value) --> ldapPublicKey --> Por AHORA!: crear directorio /home/{user}»
- 12:38 18 feb 2022 difs. hist. +266 N ClusterQB:Infra Página creada con «= Infraestructura y configuración del cluster = * Wiki * Usuarios * Monitoreo * Red * Estorash * Slurm * Notebooks»
- 19:14 17 feb 2022 difs. hist. −792 Página principal Página reemplazada por «Próximamente...» Etiqueta: Reemplazo
- 19:13 17 feb 2022 difs. hist. 0 MediaWiki:Sidebar
- 19:12 17 feb 2022 difs. hist. +7 MediaWiki:Sidebar
- 18:42 17 feb 2022 difs. hist. +165 N MediaWiki:Sidebar Página creada con « * navigation ** mainpage|mainpage-description ** recentchanges-url|recentchanges ** randompage-url|randompage ** helppage|help-mediawiki * algo ** cosas|otras-cosas»